作者: 廠商動態(tài)
自 “孟德爾摩根從豌豆的種植發(fā)現(xiàn)基因以后，二百年內(nèi)世界上沒有任何人理解這個概念，兩百年后基因研究才慢慢發(fā)展起來”?；蚬こ淘诤荛L一段時間處于靜默期，進入21世紀后，隨著科研水平和IT技術(shù)的發(fā)展，基因工程有了突飛猛進的發(fā)展，讓人們利用基因組信息開展精準醫(yī)療并最終改善人類健康成為可能。
從單個基因解密到今天大規(guī)模人群基因組、臨床表征等數(shù)據(jù)的快速積累，基因組研究在近期實現(xiàn)了質(zhì)的飛躍。業(yè)內(nèi)專家認識到，要想真正實現(xiàn)基因組信息服務(wù)于人類，一方面必須有針對遺傳性疾病、腫瘤等針對性的診療的解決方法，另一方面必須解決海量基因組和臨床數(shù)據(jù)的存儲、分析和共享等方面的挑戰(zhàn)。這正是精準醫(yī)學產(chǎn)業(yè)的巨大發(fā)展機遇。
從全球看，精準醫(yī)療正在得到越來越多國家的重視。國際上目前3個大洲的8個國家紛紛公布了國家精準醫(yī)學計劃，中國“十三五發(fā)展規(guī)劃”也把精準醫(yī)學作為戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)。伴隨著精準醫(yī)學研究項目在全球以及國內(nèi)的全面推進，如何圍繞精準醫(yī)學更好地服務(wù)廣大老百姓成為醫(yī)療行業(yè)領(lǐng)導(dǎo)者思考的問題。如果能基于云計算技術(shù)打造一個充分整合醫(yī)藥研發(fā)經(jīng)驗和的精準醫(yī)學處理技術(shù)的大數(shù)據(jù)云平臺，是不是就能更好地幫助醫(yī)療機構(gòu)未患者提供方便快捷的精準醫(yī)療服務(wù)呢?藥明康德明碼生物科技公司審時度勢，富有前瞻性地認識到了這其中的市場機遇。
華為企業(yè)云加速精準醫(yī)療云落地
國內(nèi)首個精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)云平臺誕生
在幾年前，冰島完成了全球迄今為止完成的規(guī)模最大的國家精準醫(yī)學研究，對全國總共35萬人口進行了全基因測序，這就產(chǎn)生了30多PB的數(shù)據(jù)，然而，冰島當時的deCODE公司使用的Oracle 數(shù)據(jù)庫的架構(gòu)無法高效的處理這種海量的數(shù)據(jù)，于是deCODE公司的IT負責人，來自MIT的計算機系教授另辟蹊徑，自己創(chuàng)造了一種適用于基因組大數(shù)據(jù)處理的GOR數(shù)據(jù)庫。這套系統(tǒng)是目前全球唯一一個處理過30多萬人全基因組的數(shù)據(jù)，并在多項國際競標的項目中獲得了多個國家精準醫(yī)學項目的認可，包括英國10萬人基因組、卡塔爾的35萬人基因組計劃，以及美國西蒙基金會自閉癥的基因組計劃等等。
GOR數(shù)據(jù)庫及在此基礎(chǔ)上開發(fā)的序列分析、臨床序列分析和腫瘤分析模塊構(gòu)成了今天藥明康德明碼科技的精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析平臺，并已在冰島、卡塔爾和英國的國家級精準醫(yī)學項目上得到廣泛認可和使用。我們完全有理由相信，這一得到國際認可的數(shù)據(jù)分析平臺同樣也能為中國的國家精準醫(yī)學項目做出突出的貢獻。
今年五月，藥明康德聯(lián)合華為企業(yè)云發(fā)布了中國首個精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)云平臺---明碼云。明碼云旨在打造覆蓋全國、標準統(tǒng)一、安全可靠的精準醫(yī)學云服務(wù)，推動國內(nèi)基因組信息及精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)的集中和應(yīng)用，促進政府相關(guān)部門、醫(yī)療行業(yè)、學術(shù)界以及業(yè)界在精準醫(yī)學領(lǐng)域的交流與合作，全面助力中國的精準醫(yī)學計劃。
明碼云所獨有的GOR技術(shù)世界領(lǐng)先，在全基因組數(shù)據(jù)查詢速度上比基于Hadoop的大數(shù)據(jù)整合平臺高出10倍。明碼云中的WuXiNextCODE cloud系統(tǒng)是專門為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)而開發(fā)的，其通過獨有的彈性計算與數(shù)據(jù)存儲設(shè)備實現(xiàn)快速數(shù)據(jù)導(dǎo)入和導(dǎo)出。專為基因組設(shè)計的GOR數(shù)據(jù)庫結(jié)合臨床序列分析序列挖掘模塊為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)的全面分析提供了更加高效的工具。此外，為了保證數(shù)據(jù)的隱私和安全，明碼云在軟件系統(tǒng)使用了美國DNANexus的安全系統(tǒng)，后者已經(jīng)被美國的國家精準醫(yī)學計劃所采用。
華為企業(yè)云為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)處理提供強有力的支撐
精準醫(yī)學云平臺需要一個可以通過普通互聯(lián)網(wǎng)獲取專業(yè)的計算資源的快捷通道;一個按需配置，計量收費，用完釋放的高效系統(tǒng);可定制化、彈性可擴展的存儲系統(tǒng)以及界面友好，操作簡單的管理界面。
華為企業(yè)云是一家專注打造企業(yè)級云基礎(chǔ)設(shè)施服務(wù)的供應(yīng)商，藥明康德的明碼云選擇與華為企業(yè)云合作，第一保證了IT架構(gòu)安全，穩(wěn)定，可信賴，華為企業(yè)云所有的機房都是采用T3+標準進行建設(shè)，相較于傳統(tǒng)信息化，云服務(wù)提供專業(yè)的安全保障體系，通過分布式存儲和異地災(zāi)備為客戶的數(shù)據(jù)和業(yè)務(wù)保駕護航;第二是可以獲得專業(yè)的IT構(gòu)架維護，華為專業(yè)的人員維護為客戶免去維護的后顧之憂，讓專業(yè)的人做專業(yè)的事，客戶更聚焦自身的核心業(yè)務(wù)。第三. 使用效率高，傳統(tǒng)信息化建設(shè)需要招標、采購、選型等繁瑣的流程，需要大量的時間，上線一套系統(tǒng)往往需要3-5個月的時間，但是云服務(wù)資源是隨時使用的，通過在網(wǎng)站上的簡單操作即可10分鐘快速開通所需資源;第四、輕松擴展，企業(yè)的一些應(yīng)用會面臨著業(yè)務(wù)浪涌和快速擴展，而云服務(wù)擁有海量資源池，可以支持企業(yè)業(yè)務(wù)彈性擴展;第五，資源共享，基于云計算的統(tǒng)一建設(shè)，實現(xiàn)資源最大程度的共享，同時有利于數(shù)據(jù)集中進行大數(shù)據(jù)分析;第六，覆蓋全國的網(wǎng)絡(luò)IT資源，華為企業(yè)云目前已經(jīng)在全國布局20余個數(shù)據(jù)中心;
華為公司領(lǐng)先的云計算技術(shù)水平和運營能力，結(jié)合藥明康德世界一流的醫(yī)藥研發(fā)能力，以及明碼生物科技在分析、挖掘、共享基因組學及精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)方面端到端的豐富技術(shù)經(jīng)驗，將為中國精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)建立一個可信賴本地化的云計算、云存儲、云分享和交換的全國云服務(wù)網(wǎng)絡(luò)平臺。
借力云計算，加快推動精準醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展
“明碼云”平臺所采用的相關(guān)技術(shù)此前已經(jīng)被同步應(yīng)用于世界四大洲的智慧城市建設(shè)，以及全球多個國家和地區(qū)的精準醫(yī)學項目：從基因發(fā)現(xiàn)到國家基因組計劃，從臨床診斷到智慧醫(yī)院，從靶向藥物研發(fā)到個性化健康管理，一個統(tǒng)一的云平臺可以實時支持基因組學的臨床及科學研究，通過“全國聯(lián)網(wǎng)”在國家層面高效推動精準醫(yī)學研究項目的開展。
目前，精準醫(yī)療領(lǐng)域的發(fā)展在全球尚處于起步期。不過，已經(jīng)有部分醫(yī)療機構(gòu)和已經(jīng)在用基因檢測作為遺傳性疾病的診斷手段。例如，在罕見病診斷領(lǐng)域全球領(lǐng)先的波士頓兒童醫(yī)院就在用明碼云平臺的數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)進行遺傳病的診斷;國內(nèi)兒科領(lǐng)域的領(lǐng)軍者復(fù)旦大學附屬兒科醫(yī)院也在使用該系統(tǒng)做遺傳病的診斷，并成立了罕見病中心。除此之外，其他的一些機構(gòu)正在使用這一系統(tǒng)進行基因檢測，以作為抗腫瘤精準用藥的指導(dǎo)。
另一方面，美國的西蒙基金會也是明碼云的用戶，前者擁有目前全球最大自閉癥基因數(shù)據(jù)庫，包含來自閉癥患兒家庭的10,000個外顯子組數(shù)據(jù)。如今，他們可以通過明碼生物科技的臨床發(fā)現(xiàn)分析工具進行云端查詢，凝聚基因組和互聯(lián)網(wǎng)，實現(xiàn)實時查詢與合作。作為數(shù)據(jù)標準以及空前規(guī)模的自閉癥基因組學研究的樞紐，這一數(shù)據(jù)庫能夠與世界上的其他主要數(shù)據(jù)庫無縫對接。可以說，以云計算平臺為依托的基因組醫(yī)療大數(shù)據(jù)的時代已經(jīng)來臨。
小結(jié)：
精準醫(yī)療是一種將個人基因、環(huán)境與生活習慣差異考慮在內(nèi)的新型醫(yī)學概念與醫(yī)療模式，是下一代醫(yī)學的發(fā)展方向，云計算是未來的發(fā)展趨勢，將為企業(yè)創(chuàng)新、信息成本降低、工作方式及商業(yè)模式等帶來根本性改變。
明碼云就是藥明康德依托華為企業(yè)云進軍精準醫(yī)學產(chǎn)業(yè)的一個重要平臺。依托華為企業(yè)云，實現(xiàn)在云端有效完成數(shù)據(jù)存儲，分析和管理，將最后結(jié)果交付給專業(yè)的人做專業(yè)的事。藥明康德與華為企業(yè)云的深度合作還體現(xiàn)在人口和疾病隊列的精準醫(yī)學項目上，通過整合臨床研究檢測數(shù)據(jù)與基因組數(shù)據(jù)，將其進行存儲、次級處理以及個性化的高級分析，從而來發(fā)現(xiàn)藥物靶點以及生物標志物。
相信雙方的合作可以幫助行業(yè)和科研工作者更加充分地利用基因組學和大數(shù)據(jù)的力量，推動中國精準醫(yī)學研究以及個性化健康管理，最終實現(xiàn)以基因為出發(fā)點來規(guī)劃個人的飲食生活習慣，達到精準健康的目的。